保姆级KEGG数据库教程！医学人如何入门KEGG？信号通路分析必学功 …
Aug 18, 2022 · 1. KEGG PATHWAY 这部分应该就是大家最熟悉的啦，也是KEGG数据库最核心的部分。 它包含了与通路相关的各种信息，我们解螺旋也有相关课程教大家使用，在此就不赘述。 2. KEGG …
为啥目标基因在kegg富集分析时，没有kegg pathway通路，只有kegg …
在进行KEGG富集分析时，如果发现目标基因只富集到了KEGG BRITE分类而不是经典的KEGG pathway，这可能意味着以下几种情况： 1. 数据特异性： 你的基因集可能富含一些较为新颖或特定 …
KEGG 怎么用？ - 知乎
9. KEGG NETWORK 这部分和上面的KEGG DISEASE比较像，它是KEGG尝试从扰乱的分子网络中获取有关疾病和药物的信息。这部分主要包含了癌症、内分泌和代谢性疾病、病毒和细菌感染三部分内容 …
在KEGG分析中，富集到的Pathway比较少（个位数），怎么办？ - 知乎
在 KEGG 分析中出现符合 q 值 < 0.50 的富集 Pathway 数量较少的情况，可以考虑以下几种方法来优化和展示结果： 回顾数据预处理步骤，确保基因表达数据、差异基因筛选等过程准确无误，避免因数据 …
大佬们，请问KEGG共富集后，有很多通路如何选择关键通路？？？ - 知乎
大佬们，请问KEGG共富集后，有很多通路如何选择关键通路？ ？？ 大佬们，有没有人知道植物组织送样后，数据回来的转录，蛋白，代谢多组学联合分析的KEGG共富集有十多天通路，如何确定关键的 …
GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? - 知乎
GO（Gene Ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是常用的基因功能注释和通路分析工具。 如果想筛选自己想要的基因进行GO和KEGG分析，可以按照以下步骤进行： 获取 …
单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别？ - 知乎
单细胞测序中GO、KEGG、GSEA分析是三种常用的高级分析方法，它们各有特点和应用场景，以下是它们的主要区别： GO分析 1.定义与目的： Gene Ontology（GO）是一个国际标准化的基因功能分类 …
kegg气泡图能看出通路是上调还是下调吗？ - 知乎
Nov 5, 2024 · KEGG气泡图本身并不直接显示通路是上调还是下调。 气泡图主要用于展示基因在特定通路中的富集情况，通常通过富集程度（如富集比值Rich factor、q值或-log10 (p值)）和基因数量来表 …
请问如何检索kegg数据库？ - 知乎
1、什么是KEGG？ KEGG，Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因和基因组百科全书，是系统分析基因功能，联系基因组信息和功能信息的知识库。KEGG是一个综合数据库，它们大致 …
请问KEGG特异性通路图怎么看？ - 知乎
请问KEGG特异性通路图怎么看？ 刚入行小白提问，一个物种的KEGG特异性通路图，基因标注有白框的和绿框的。 绿框的是一定存在的基因吗？ 白框的是一定不存在的基因吗？ 这里面有什么门道吗？ …